Das Reproduktionszentrum für Pferde, das der klinischen Abteilung des Gestüts Alter angegliedert ist, stellt sowohl die Reproduktionskontrolle des Pferdebestands des Gestüts Alter sicher als auch die Anfragen von Kunden außerhalb des Gestüts. Diese Abteilung unterstützt auch den stationären, chirurgischen und internistischen Dienst und arbeitet im Wochenenddienstplan mit.

Die klinische Abteilung des Gestüts Alter ist Teil des Zentrums der Universität von Évora und verfügt über eine hervorragende Ausstattung für die Behandlung und Forschung von Pferden. Das zwischen dem Gestüt Alter do Chão und der Universität Évora unterzeichnete Protokoll legt fest, dass die praktischen Pferdekurse des integrierten Masterstudiengangs Veterinärmedizin dieser Universität im realen Kontext des Gestüts durchgeführt werden.

Die Berufsschule für ländliche Entwicklung Alter do Chão (EPDRAC) ist ebenfalls auf dem Gelände des Gestüts Alter tätig. Im Einklang mit den Erfordernissen der ländlichen Entwicklung im Landesinneren werden hier die Berufsausbildungen zum Pferdewirtschaftsmeister, Techniker für landwirtschaftliche Produktion, Techniker für Reittourismus und Techniker für Umwelt- und Landtourismus unterrichtet. Die Schule bietet auch Aus- und Weiterbildungskurse an, wie z.B. Pferdewirt und Raufutter, Gartenbau/Obstbau und landwirtschaftlicher Betriebsleiter.