El Centro de Reproducción Equina, adscrito a la Unidad Clínica de la Yeguada Alter, asegura tanto el control reproductivo de la cabaña equina de la Yeguada Alter como atiende las peticiones de clientes externos a la yeguada. Esta unidad también presta apoyo, asistiendo al servicio de hospitalización y cirugía y medicina interna y colaborando en el turno de guardia de fin de semana.

La Unidad Clínica de la Yeguada Alter funciona como parte del centro de la Universidad de Évora y está dotada de un excelente equipamiento para el tratamiento y la investigación equina. El protocolo firmado entre la Yeguada Alter y la Universidad de Évora determina que las clases prácticas equinas del máster integrado en Veterinaria de esta universidad se realicen en el contexto real de la yeguada.

La Escuela Profesional de Desarrollo Rural de Alter do Chão (EPDRAC) también funciona dentro del perímetro de la Yeguada Alter. En sintonía con las necesidades de desarrollo rural del interior del país, en este centro de enseñanza se imparten los cursos profesionales de Técnico en Gestión Equina, Técnico en Producción Agropecuaria, Técnico en Acompañamiento de Turismo Ecuestre y Técnico en Medio Ambiente y Turismo Rural. La Escuela también imparte Cursos de Formación y Capacitación, como el de Manipulador y Desbrave Equino, el de Horticultura/Fruticultura y el de Operario Agrícola.